大众ID.3采用高压扁平电池包、整个电池包内部集成了液冷系统，并采用轻量化处理，使得这辆车整车的车身重量为1719kg。此外，大众还宣布为ID.3电池包提供8年或16万公里质保。

大众ID.3会有三个电池容量车型可选,分别为45kWh、58 kWh、77 kWh，对应着不同的续航里程，WLTP标准下续航里程分别为330km、420km、550km。

大众ID.3车轮采用四角布局，为车辆底部腾出尽可能多的电池布置空间，这也是大众MEB平台的一个显著特征。

在MEB平台中，动力电池布置在车辆前、后桥之间，可实现载荷的均匀分布。该电池可驱动前桥或后桥，或者同时驱动前后桥，具体情况则视车辆设计及类型而定。